Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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