Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms