Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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