Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms