Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF17Q9BXT8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF17Q9BXT8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms