Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms