Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms