Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLVAPQ9BX97 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLVAPQ9BX97 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms