Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms