Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms