Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC22A12Q96S37 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms