Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT140Q96RY7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IFT140Q96RY7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms