Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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