Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF354BQ96LW1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms