Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRIQ1Q96JM4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRIQ1Q96JM4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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