Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BORCS6Q96GS4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms