Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF183Q96D59 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF183Q96D59 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms