Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GCN1Q92616 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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GCN1Q92616 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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GCN1Q92616 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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GCN1Q92616 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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GCN1Q92616 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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GCN1Q92616 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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GCN1Q92616 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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GCN1Q92616 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCN1Q92616 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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