Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TOPBP1Q92547 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPBP1Q92547 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms