Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SELENOMQ8WWX9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms