Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC21AQ8NDW8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC21AQ8NDW8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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