Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APCDD1LQ8NCL9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms