Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLDN19Q8N6F1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLDN19Q8N6F1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CLDN19Q8N6F1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLDN19Q8N6F1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLDN19Q8N6F1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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