Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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ARHGEF39Q8N4T4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF39Q8N4T4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARHGEF39Q8N4T4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF39Q8N4T4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms