Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMNTD2Q8IXW0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms