Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNMB4Q86W47 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms