Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms