Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WDR88Q6ZMY6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms