Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms