Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF20Q5VT98 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF20Q5VT98 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms