Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM78BQ5VT40 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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