Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RIF1Q5UIP0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms