Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HES3Q5TGS1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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