Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LGSNQ5TDP6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms