Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ODF2Q5BJF6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms