Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC92Q53HC0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms