Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HSD17B12Q53GQ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HSD17B12Q53GQ0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms