Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRNQ16849 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRNQ16849 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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