Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FXNQ16595 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FXNQ16595 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FXNQ16595 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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