Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TWIST1Q15672 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms