Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
IRF4Q15306 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms