Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAB3GAP1Q15042 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB3GAP1Q15042 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB3GAP1Q15042 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB3GAP1Q15042 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB3GAP1Q15042 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RAB3GAP1Q15042 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB3GAP1Q15042 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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