Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNGB1Q14028 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms