Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CKAP5Q14008 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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