Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
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SHROOM2Q13796 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHROOM2Q13796 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHROOM2Q13796 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
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