Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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