Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1orf61Q13536 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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