Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms