Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRDM2Q13029 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM2Q13029 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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