Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC15Q0P6D6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms